Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFNA1P20827 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFNA1P20827 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms