Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB3P05106 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3P05106 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms