Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCP110O43303 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCP110O43303 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCP110O43303 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCP110O43303 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCP110O43303 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCP110O43303 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCP110O43303 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCP110O43303 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCP110O43303 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCP110O43303 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCP110O43303 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCP110O43303 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCP110O43303 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCP110O43303 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCP110O43303 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCP110O43303 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCP110O43303 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCP110O43303 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCP110O43303 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCP110O43303 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCP110O43303 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCP110O43303 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCP110O43303 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCP110O43303 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms