Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF3BA8MYP8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms