Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC78A2IDD5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms