Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 TNRC18-207ENST00000440081 757 ntTSL 311.34□□□□□ -0.597e-9■■■■■ 31.8
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 23.56□□□□□ -1.844e-7■■■■■ 31.6
UTP18Q9Y5J1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 30.6
UTP18Q9Y5J1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.475e-6■■■■■ 30.6
UTP18Q9Y5J1 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 30.6
UTP18Q9Y5J1 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.15e-6■■■■■ 30.6
UTP18Q9Y5J1 PLXNB2-205ENST00000432455 1620 ntTSL 519.54■□□□□ 0.724e-8■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 PLXNB2-203ENST00000425954 609 ntTSL 218.4■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.064e-8■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 228.95■■■□□ 2.225e-6■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.035e-6■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.625e-6■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 320.93■□□□□ 0.945e-6■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 519.06■□□□□ 0.645e-6■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 216.1■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 315.3■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 29.3
UTP18Q9Y5J1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.813e-6■■■■■ 29.2
UTP18Q9Y5J1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.577e-6■■■■■ 29.1
UTP18Q9Y5J1 CYBA-203ENST00000562209 624 ntTSL 520.13■□□□□ 0.817e-6■■■■■ 29.1
UTP18Q9Y5J1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.577e-6■■■■■ 29.1
UTP18Q9Y5J1 CYBA-202ENST00000561972 464 ntTSL 317.08■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 29.1
UTP18Q9Y5J1 CYBA-204ENST00000563526 1052 ntTSL 216.35■□□□□ 0.217e-6■■■■■ 29.1
UTP18Q9Y5J1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 29.1
UTP18Q9Y5J1 CYBA-206ENST00000566229 405 ntTSL 315.14■□□□□ 0.017e-6■■■■■ 29.1
UTP18Q9Y5J1 CYBA-207ENST00000566534 1006 ntTSL 515.14■□□□□ 0.017e-6■■■■■ 29.1
UTP18Q9Y5J1 CYBA-209ENST00000568278 439 ntTSL 513.84□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 29.1
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 28
UTP18Q9Y5J1 FASTK-213ENST00000482806 1826 ntTSL 524.73■■□□□ 1.553e-8■■■■■ 27.8
UTP18Q9Y5J1 FASTK-215ENST00000489884 1751 ntTSL 1 (best)23.92■■□□□ 1.423e-8■■■■■ 27.8
UTP18Q9Y5J1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.373e-8■■■■■ 27.8
UTP18Q9Y5J1 FASTK-216ENST00000496663 818 ntTSL 223.3■■□□□ 1.323e-8■■■■■ 27.8
UTP18Q9Y5J1 FASTK-205ENST00000461979 720 ntTSL 522.52■■□□□ 1.23e-8■■■■■ 27.8
UTP18Q9Y5J1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.183e-8■■■■■ 27.8
UTP18Q9Y5J1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.163e-8■■■■■ 27.8
UTP18Q9Y5J1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 27.8
UTP18Q9Y5J1 FASTK-204ENST00000460980 1521 ntTSL 516.97■□□□□ 0.313e-8■■■■■ 27.8
UTP18Q9Y5J1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 27.2
UTP18Q9Y5J1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 27.2
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 27
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 220.02■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 27
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 218.26■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 27
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.153e-7■■■■□ 26.7
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.143e-7■■■■□ 26.7
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-7■■■■□ 26.7
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 310.41□□□□□ -0.743e-7■■■■□ 26.7
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 26.7
UTP18Q9Y5J1 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 56.69□□□□□ -1.343e-7■■■■□ 26.7
UTP18Q9Y5J1 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.714e-7■■■■□ 26.6
UTP18Q9Y5J1 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 318.91■□□□□ 0.621e-6■■■■□ 26.3
UTP18Q9Y5J1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.977e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.737e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.697e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.657e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.587e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.587e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.147e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.147e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.077e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.17e-58■■■■□ 26
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.983e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.723e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.613e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 524.78■■□□□ 1.563e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.523e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.453e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.353e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.323e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.163e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.588e-6■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.518e-6■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 517.98■□□□□ 0.473e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-226ENST00000490583 888 ntTSL 317.51■□□□□ 0.393e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.318e-6■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.183e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.118e-6■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-213ENST00000444651 847 ntTSL 314.97□□□□□ -0.013e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 ZDHHC8-206ENST00000469212 625 ntTSL 314.86□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 314.86□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 TANGO2-221ENST00000476940 414 ntTSL 512.53□□□□□ -0.43e-8■■■■□ 25.9
UTP18Q9Y5J1 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-7■■■■□ 25.7
UTP18Q9Y5J1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-6■■■■□ 25.3
UTP18Q9Y5J1 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 25.2
UTP18Q9Y5J1 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 25.2
UTP18Q9Y5J1 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 25.2
UTP18Q9Y5J1 CDC45-203ENST00000407835 2090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 25.2
UTP18Q9Y5J1 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 222.45■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 25.1
UTP18Q9Y5J1 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)20.39■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 25.1
UTP18Q9Y5J1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 25.1
UTP18Q9Y5J1 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 25.1
UTP18Q9Y5J1 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)16.4■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 25.1
UTP18Q9Y5J1 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.962e-37■■■■□ 24.9
UTP18Q9Y5J1 HS6ST1-204ENST00000494089 585 ntTSL 218.19■□□□□ 0.54e-7■■■■□ 24.9
UTP18Q9Y5J1 HS6ST1-203ENST00000469019 559 ntTSL 416.13■□□□□ 0.174e-7■■■■□ 24.9
UTP18Q9Y5J1 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-7■■■■□ 24.9
UTP18Q9Y5J1 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.124e-7■■■■□ 24.9
UTP18Q9Y5J1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 24.7
Retrieved 100 of 2,623 protein–RNA pairs in 167 ms