Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVP2

GNL3, Guanine nucleotide-binding protein-like 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNL3Q9BVP2 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.689e-11■■□□□ 14.2
GNL3Q9BVP2 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 310.31□□□□□ -0.769e-11■■□□□ 14.2
GNL3Q9BVP2 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.81e-323■■□□□ 13.8
GNL3Q9BVP2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.55■■■□□ 2.482e-6■■□□□ 13.6
GNL3Q9BVP2 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 221.04■□□□□ 0.962e-6■■□□□ 13.6
GNL3Q9BVP2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 13.6
GNL3Q9BVP2 CYBA-205ENST00000565588 221 ntTSL 213.04□□□□□ -0.322e-8■■□□□ 13.5
GNL3Q9BVP2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.211e-6■■□□□ 13.4
GNL3Q9BVP2 INSIG1-206ENST00000476756 1320 ntTSL 213.58□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 13.4
GNL3Q9BVP2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.728e-16■■□□□ 13.1
GNL3Q9BVP2 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 524.98■■□□□ 1.598e-16■■□□□ 13.1
GNL3Q9BVP2 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.07□□□□□ -0.648e-7■■□□□ 13.1
GNL3Q9BVP2 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 411.68□□□□□ -0.542e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 411.68□□□□□ -0.542e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 411.22□□□□□ -0.612e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 210.29□□□□□ -0.762e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 48.91□□□□□ -0.982e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 28.43□□□□□ -1.062e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 48.37□□□□□ -1.072e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-39■■□□□ 12.5
GNL3Q9BVP2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.583e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.113e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 513.45□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 VMP1-208ENST00000588617 884 ntTSL 413.38□□□□□ -0.273e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 513.21□□□□□ -0.293e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.423e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 VMP1-215ENST00000592619 838 ntTSL 512.03□□□□□ -0.483e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 VMP1-213ENST00000591877 791 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 HMGCS1-207ENST00000514610 555 ntTSL 210.75□□□□□ -0.696e-16■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 VMP1-205ENST00000587470 995 ntTSL 29.97□□□□□ -0.813e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 29.34□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 VMP1-212ENST00000591782 729 ntTSL 57.46□□□□□ -1.223e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 VMP1-216ENST00000592790 4325 nt3.96□□□□□ -1.783e-6■■□□□ 12.1
GNL3Q9BVP2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.822e-6■■□□□ 12
GNL3Q9BVP2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 12
GNL3Q9BVP2 HIST1H3J-202ENST00000479986 522 ntTSL 226.37■■□□□ 1.811e-10■■□□□ 11.8
GNL3Q9BVP2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.345e-8■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 CYBA-203ENST00000562209 624 ntTSL 523.35■■□□□ 1.335e-8■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.855e-8■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 CYBA-204ENST00000563526 1052 ntTSL 218.61■□□□□ 0.575e-8■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.435e-8■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 CYBA-206ENST00000566229 405 ntTSL 316.7■□□□□ 0.265e-8■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 CYBA-207ENST00000566534 1006 ntTSL 516.7■□□□□ 0.265e-8■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 CYBA-209ENST00000568278 439 ntTSL 515.58■□□□□ 0.085e-8■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 ANP32A-207ENST00000486054 2015 ntTSL 220.14■□□□□ 0.812e-13■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.532e-13■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 317.92■□□□□ 0.462e-13■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 517.47■□□□□ 0.392e-13■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 510.2□□□□□ -0.782e-13■■□□□ 11.6
GNL3Q9BVP2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.338e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.288e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 211.73□□□□□ -0.538e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.558e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 311.39□□□□□ -0.598e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 511.39□□□□□ -0.598e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 210.49□□□□□ -0.738e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 29.65□□□□□ -0.868e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.898e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 39.52□□□□□ -0.898e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 28.58□□□□□ -1.048e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.048e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 38.52□□□□□ -1.058e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 28.41□□□□□ -1.068e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 38.24□□□□□ -1.098e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 27.63□□□□□ -1.198e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 27.2□□□□□ -1.268e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.288e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 56.71□□□□□ -1.348e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.348e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.488e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.59□□□□□ -1.518e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.518e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 24.36□□□□□ -1.718e-28■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.516e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.56e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 317.04■□□□□ 0.326e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.316e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.186e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.096e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.076e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.066e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.076e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.16e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.26e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.336e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.366e-7■□□□□ 11.3
GNL3Q9BVP2 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.714e-46■□□□□ 11
GNL3Q9BVP2 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-323■□□□□ 11
GNL3Q9BVP2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.633e-6■□□□□ 10.9
GNL3Q9BVP2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.213e-6■□□□□ 10.9
GNL3Q9BVP2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.943e-6■□□□□ 10.9
GNL3Q9BVP2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.793e-6■□□□□ 10.9
GNL3Q9BVP2 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 10.9
GNL3Q9BVP2 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)25.24■■□□□ 1.632e-17■□□□□ 10.8
GNL3Q9BVP2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.482e-17■□□□□ 10.8
GNL3Q9BVP2 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 223.37■■□□□ 1.332e-17■□□□□ 10.8
GNL3Q9BVP2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.172e-17■□□□□ 10.8
GNL3Q9BVP2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.722e-17■□□□□ 10.8
Retrieved 100 of 598 protein–RNA pairs in 23.4 ms