Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMCHL2Q9BQD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMCHL2Q9BQD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PMCHL2Q9BQD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PMCHL2Q9BQD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMCHL2Q9BQD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms