Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4LQ96PU5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD4LQ96PU5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4LQ96PU5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD4LQ96PU5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD4LQ96PU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4LQ96PU5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD4LQ96PU5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4LQ96PU5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD4LQ96PU5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD4LQ96PU5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD4LQ96PU5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4LQ96PU5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms