Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YLR111WYLR111W 333 nt11.38□□□□□ -0.59
CLF1Q12309 SHH4YLR164W 507 nt11.38□□□□□ -0.59
CLF1Q12309 SDH5YOL071W 489 nt11.38□□□□□ -0.59
CLF1Q12309 TOM6YOR045W 186 nt11.37□□□□□ -0.59
CLF1Q12309 UTH1YKR042W 1098 nt11.36□□□□□ -0.59
CLF1Q12309 FUR4YBR021W 1902 nt11.36□□□□□ -0.59
CLF1Q12309 LSC2YGR244C 1284 nt11.35□□□□□ -0.59
CLF1Q12309 YML089CYML089C 369 nt11.35□□□□□ -0.59
CLF1Q12309 PEX2YJL210W 816 nt11.33□□□□□ -0.6
CLF1Q12309 POM34YLR018C 900 nt11.33□□□□□ -0.6
CLF1Q12309 PRO1YDR300C 1287 nt11.32□□□□□ -0.6
CLF1Q12309 ATG15YCR068W 1563 nt11.31□□□□□ -0.6
CLF1Q12309 RPS14BYJL191W 417 nt11.3□□□□□ -0.6
CLF1Q12309 NRT1YOR071C 1797 nt11.28□□□□□ -0.6
CLF1Q12309 RTN2YDL204W 1182 nt11.27□□□□□ -0.61
CLF1Q12309 HIP1YGR191W 1812 nt11.27□□□□□ -0.61
CLF1Q12309 ARP6YLR085C 1317 nt11.25□□□□□ -0.61
CLF1Q12309 MET28YIR017C 564 nt11.24□□□□□ -0.61
CLF1Q12309 HSP60YLR259C 1719 nt11.23□□□□□ -0.61
CLF1Q12309 TSC10YBR265W 963 nt11.23□□□□□ -0.61
CLF1Q12309 RAD23YEL037C 1197 nt11.21□□□□□ -0.61
CLF1Q12309 TIF6YPR016C 738 nt11.2□□□□□ -0.62
CLF1Q12309 GAP1YKR039W 1809 nt11.2□□□□□ -0.62
CLF1Q12309 YGR259CYGR259C 441 nt11.19□□□□□ -0.62
CLF1Q12309 YGR012WYGR012W 1182 nt11.17□□□□□ -0.62
CLF1Q12309 YKR005CYKR005C 1578 nt11.16□□□□□ -0.62
CLF1Q12309 PLB1YMR008C 1995 nt11.16□□□□□ -0.62
CLF1Q12309 BMT6YLR063W 1098 nt11.14□□□□□ -0.63
CLF1Q12309 FIT3YOR383C 615 nt11.14□□□□□ -0.63
CLF1Q12309 MCH5YOR306C 1566 nt11.14□□□□□ -0.63
CLF1Q12309 PRP4YPR178W 1398 nt11.14□□□□□ -0.63
CLF1Q12309 SAM1YLR180W 1149 nt11.11□□□□□ -0.63
CLF1Q12309 RIB3YDR487C 627 nt11.06□□□□□ -0.64
CLF1Q12309 YLR279WYLR279W 390 nt11.05□□□□□ -0.64
CLF1Q12309 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.05□□□□□ -0.64
CLF1Q12309 FRE6YLL051C 2139 nt11.05□□□□□ -0.64
CLF1Q12309 ALG12YNR030W 1656 nt11.04□□□□□ -0.64
CLF1Q12309 SAM35YHR083W 990 nt11.03□□□□□ -0.64
CLF1Q12309 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.03□□□□□ -0.64
CLF1Q12309 SSN3YPL042C 1668 nt11.03□□□□□ -0.64
CLF1Q12309 DPS1YLL018C 1674 nt11.02□□□□□ -0.64
CLF1Q12309 YAR028WYAR028W 705 nt11.02□□□□□ -0.65
CLF1Q12309 DIF1YLR437C 402 nt11.01□□□□□ -0.65
CLF1Q12309 UTR1YJR049C 1593 nt11.01□□□□□ -0.65
CLF1Q12309 MSB4YOL112W 1479 nt11□□□□□ -0.65
CLF1Q12309 ALP1YNL270C 1722 nt10.98□□□□□ -0.65
CLF1Q12309 AKR2YOR034C 2250 nt10.97□□□□□ -0.65
CLF1Q12309 IRC24YIR036C 792 nt10.95□□□□□ -0.66
CLF1Q12309 CAB5YDR196C 726 nt10.94□□□□□ -0.66
CLF1Q12309 AAC1YMR056C 930 nt10.91□□□□□ -0.66
CLF1Q12309 MTG2YHR168W 1557 nt10.9□□□□□ -0.66
CLF1Q12309 ZTA1YBR046C 1005 nt10.9□□□□□ -0.66
CLF1Q12309 PRM5YIL117C 957 nt10.89□□□□□ -0.67
CLF1Q12309 GND1YHR183W 1470 nt10.87□□□□□ -0.67
CLF1Q12309 LOT5YKL183W 921 nt10.87□□□□□ -0.67
CLF1Q12309 YPI1YFR003C 468 nt10.86□□□□□ -0.67
CLF1Q12309 SED1YDR077W 1017 nt10.85□□□□□ -0.67
CLF1Q12309 YJL195CYJL195C 702 nt10.83□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 LIP1YMR298W 453 nt10.81□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 ALD4YOR374W 1560 nt10.8□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 SMM1YNR015W 1155 nt10.79□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 ADH1YOL086C 1047 nt10.79□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.79□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 FUN14YAL008W 597 nt10.78□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 STE4YOR212W 1272 nt10.78□□□□□ -0.68
CLF1Q12309 APT2YDR441C 546 nt10.77□□□□□ -0.69
CLF1Q12309 NAR1YNL240C 1476 nt10.75□□□□□ -0.69
CLF1Q12309 SNF1YDR477W 1902 nt10.74□□□□□ -0.69
CLF1Q12309 HXT1YHR094C 1713 nt10.74□□□□□ -0.69
CLF1Q12309 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.74□□□□□ -0.69
CLF1Q12309 FCY21YER060W 1587 nt10.73□□□□□ -0.69
CLF1Q12309 BIO5YNR056C 1686 nt10.73□□□□□ -0.69
CLF1Q12309 YNR029CYNR029C 1290 nt10.72□□□□□ -0.69
CLF1Q12309 GID7YCL039W 2238 nt10.71□□□□□ -0.69
CLF1Q12309 HIF1YLL022C 1158 nt10.69□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 TOA2YKL058W 369 nt10.68□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 UGA4YDL210W 1716 nt10.67□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 ADH7YCR105W 1086 nt10.67□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 RAD51YER095W 1203 nt10.67□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 PRY1YJL079C 900 nt10.67□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 DBP1YPL119C 1854 nt10.67□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 YLR349WYLR349W 507 nt10.66□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 BRR1YPR057W 1026 nt10.66□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 MEP3YPR138C 1470 nt10.66□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 BSP1YPR171W 1731 nt10.65□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 YEL008WYEL008W 381 nt10.65□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 VRG4YGL225W 1014 nt10.65□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 YBL086CYBL086C 1401 nt10.65□□□□□ -0.7
CLF1Q12309 RIB2YOL066C 1776 nt10.64□□□□□ -0.71
CLF1Q12309 PBP1YGR178C 2169 nt10.63□□□□□ -0.71
CLF1Q12309 PAU15YIR041W 375 nt10.63□□□□□ -0.71
CLF1Q12309 YPL251WYPL251W 303 nt10.63□□□□□ -0.71
CLF1Q12309 YMR103CYMR103C 363 nt10.62□□□□□ -0.71
CLF1Q12309 GPN2YOR262W 1044 nt10.62□□□□□ -0.71
CLF1Q12309 LEU9YOR108W 1815 nt10.6□□□□□ -0.71
CLF1Q12309 GND2YGR256W 1479 nt10.57□□□□□ -0.72
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