Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 NPP1YCR026C 2229 nt10.09□□□□□ -0.79
CLP1Q08685 AQY2YLL052C 450 nt10.07□□□□□ -0.8
CLP1Q08685 ESBP6YNL125C 2022 nt10.07□□□□□ -0.8
CLP1Q08685 MET2YNL277W 1461 nt10.05□□□□□ -0.8
CLP1Q08685 TIR3YIL011W 810 nt10.05□□□□□ -0.8
CLP1Q08685 SFP1YLR403W 2052 nt10.05□□□□□ -0.8
CLP1Q08685 UTH1YKR042W 1098 nt10.04□□□□□ -0.8
CLP1Q08685 NBP35YGL091C 987 nt10.03□□□□□ -0.8
CLP1Q08685 YAT1YAR035W 2064 nt10.01□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 SAM1YLR180W 1149 nt10□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 FUR4YBR021W 1902 nt9.99□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 RPS14BYJL191W 417 nt9.99□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 TOM6YOR045W 186 nt9.99□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 HEL2YDR266C 1920 nt9.99□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 HSL7YBR133C 2484 nt9.98□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 YCL074WYCL074W 927 nt9.98□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 RAD23YEL037C 1197 nt9.97□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 PEX2YJL210W 816 nt9.97□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 SHH4YLR164W 507 nt9.97□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 YML089CYML089C 369 nt9.97□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 STR3YGL184C 1398 nt9.97□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 NRT1YOR071C 1797 nt9.96□□□□□ -0.81
CLP1Q08685 TSC10YBR265W 963 nt9.96□□□□□ -0.82
CLP1Q08685 LSC2YGR244C 1284 nt9.94□□□□□ -0.82
CLP1Q08685 ATG15YCR068W 1563 nt9.92□□□□□ -0.82
CLP1Q08685 POM34YLR018C 900 nt9.92□□□□□ -0.82
CLP1Q08685 HIP1YGR191W 1812 nt9.91□□□□□ -0.82
CLP1Q08685 PRO1YDR300C 1287 nt9.91□□□□□ -0.82
CLP1Q08685 MET28YIR017C 564 nt9.91□□□□□ -0.82
CLP1Q08685 YGR012WYGR012W 1182 nt9.9□□□□□ -0.82
CLP1Q08685 DTR1YBR180W 1719 nt9.87□□□□□ -0.83
CLP1Q08685 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.87□□□□□ -0.83
CLP1Q08685 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.87□□□□□ -0.83
CLP1Q08685 ILV2YMR108W 2064 nt9.86□□□□□ -0.83
CLP1Q08685 PRP4YPR178W 1398 nt9.84□□□□□ -0.83
CLP1Q08685 RIB3YDR487C 627 nt9.83□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 FIT3YOR383C 615 nt9.83□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 TIF6YPR016C 738 nt9.83□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.81□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 DPS1YLL018C 1674 nt9.8□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 GAP1YKR039W 1809 nt9.79□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 RFC1YOR217W 2586 nt9.79□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 RTN2YDL204W 1182 nt9.79□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.79□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 ARP6YLR085C 1317 nt9.79□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.78□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.78□□□□□ -0.84
CLP1Q08685 NAR1YNL240C 1476 nt9.77□□□□□ -0.85
CLP1Q08685 YLR279WYLR279W 390 nt9.76□□□□□ -0.85
CLP1Q08685 AAC1YMR056C 930 nt9.76□□□□□ -0.85
CLP1Q08685 CMP2YML057W 1815 nt9.75□□□□□ -0.85
CLP1Q08685 YKR005CYKR005C 1578 nt9.74□□□□□ -0.85
CLP1Q08685 PLB1YMR008C 1995 nt9.72□□□□□ -0.85
CLP1Q08685 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.71□□□□□ -0.85
CLP1Q08685 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.71□□□□□ -0.85
CLP1Q08685 STE4YOR212W 1272 nt9.71□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 MSB4YOL112W 1479 nt9.71□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 YJL195CYJL195C 702 nt9.69□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 BMT6YLR063W 1098 nt9.69□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 SNF1YDR477W 1902 nt9.68□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 YPI1YFR003C 468 nt9.68□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 GTB1YDR221W 2109 nt9.67□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 CAB5YDR196C 726 nt9.67□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 ALP1YNL270C 1722 nt9.67□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 YGR259CYGR259C 441 nt9.66□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 FUN14YAL008W 597 nt9.66□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 YAR028WYAR028W 705 nt9.66□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 HEM14YER014W 1620 nt9.66□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 BIO5YNR056C 1686 nt9.65□□□□□ -0.86
CLP1Q08685 ADH7YCR105W 1086 nt9.64□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 SAM35YHR083W 990 nt9.64□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 LOT5YKL183W 921 nt9.64□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 GND1YHR183W 1470 nt9.64□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 HMG2YLR450W 3138 nt9.64□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 AKR2YOR034C 2250 nt9.63□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 TPO4YOR273C 1980 nt9.63□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 ADH1YOL086C 1047 nt9.62□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 GAL2YLR081W 1725 nt9.62□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 RAD51YER095W 1203 nt9.61□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 PAU15YIR041W 375 nt9.61□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 DIF1YLR437C 402 nt9.61□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 YNR029CYNR029C 1290 nt9.61□□□□□ -0.87
CLP1Q08685 UTR1YJR049C 1593 nt9.58□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 URA8YJR103W 1737 nt9.57□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 IRC24YIR036C 792 nt9.57□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 YLR349WYLR349W 507 nt9.57□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 PBP1YGR178C 2169 nt9.57□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 MTG2YHR168W 1557 nt9.55□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 ZTA1YBR046C 1005 nt9.55□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 TOK1YJL093C 2076 nt9.54□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 APT2YDR441C 546 nt9.54□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 SMM1YNR015W 1155 nt9.54□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 GPN2YOR262W 1044 nt9.54□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 YEL008WYEL008W 381 nt9.53□□□□□ -0.88
CLP1Q08685 UGA4YDL210W 1716 nt9.52□□□□□ -0.89
CLP1Q08685 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.51□□□□□ -0.89
CLP1Q08685 SED1YDR077W 1017 nt9.49□□□□□ -0.89
CLP1Q08685 CYT2YKL087C 675 nt9.49□□□□□ -0.89
CLP1Q08685 CPD1YGR247W 720 nt9.48□□□□□ -0.89
CLP1Q08685 MAE1YKL029C 2010 nt9.46□□□□□ -0.9
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