Protein–RNA interactions for Protein: Q06164

MMS22, E3 ubiquitin-protein ligase substrate receptor MMS22, yeastyeast

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMS22Q06164 SHH4YLR164W 507 nt15.74■□□□□ 0.11
MMS22Q06164 GPN2YOR262W 1044 nt15.74■□□□□ 0.11
MMS22Q06164 RDN18-1RDN18-1 1800 nt15.73■□□□□ 0.11
MMS22Q06164 RDN18-2RDN18-2 1800 nt15.73■□□□□ 0.11
MMS22Q06164 CLB6YGR109C 1143 nt15.71■□□□□ 0.11
MMS22Q06164 YJL195CYJL195C 702 nt15.71■□□□□ 0.11
MMS22Q06164 YCR102CYCR102C 1107 nt15.71■□□□□ 0.1
MMS22Q06164 UTH1YKR042W 1098 nt15.69■□□□□ 0.1
MMS22Q06164 PEX2YJL210W 816 nt15.66■□□□□ 0.1
MMS22Q06164 TSC10YBR265W 963 nt15.66■□□□□ 0.1
MMS22Q06164 FUR4YBR021W 1902 nt15.65■□□□□ 0.1
MMS22Q06164 TOM6YOR045W 186 nt15.64■□□□□ 0.09
MMS22Q06164 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt15.63■□□□□ 0.09
MMS22Q06164 PAC11YDR488C 1602 nt15.63■□□□□ 0.09
MMS22Q06164 YCL074WYCL074W 927 nt15.6■□□□□ 0.09
MMS22Q06164 RIB3YDR487C 627 nt15.6■□□□□ 0.09
MMS22Q06164 ADH1YOL086C 1047 nt15.58■□□□□ 0.08
MMS22Q06164 NRT1YOR071C 1797 nt15.55■□□□□ 0.08
MMS22Q06164 STR3YGL184C 1398 nt15.55■□□□□ 0.08
MMS22Q06164 MSB4YOL112W 1479 nt15.54■□□□□ 0.08
MMS22Q06164 HIP1YGR191W 1812 nt15.53■□□□□ 0.08
MMS22Q06164 TIR3YIL011W 810 nt15.52■□□□□ 0.08
MMS22Q06164 ESS1YJR017C 513 nt15.52■□□□□ 0.08
MMS22Q06164 CPD1YGR247W 720 nt15.52■□□□□ 0.07
MMS22Q06164 NBP35YGL091C 987 nt15.5■□□□□ 0.07
MMS22Q06164 YEL008WYEL008W 381 nt15.44■□□□□ 0.06
MMS22Q06164 AAC1YMR056C 930 nt15.44■□□□□ 0.06
MMS22Q06164 LOT5YKL183W 921 nt15.42■□□□□ 0.06
MMS22Q06164 YPI1YFR003C 468 nt15.4■□□□□ 0.06
MMS22Q06164 POM34YLR018C 900 nt15.38■□□□□ 0.05
MMS22Q06164 PUP1YOR157C 786 nt15.38■□□□□ 0.05
MMS22Q06164 SEN2YLR105C 1134 nt15.37■□□□□ 0.05
MMS22Q06164 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt15.36■□□□□ 0.05
MMS22Q06164 TIF6YPR016C 738 nt15.34■□□□□ 0.05
MMS22Q06164 PRO1YDR300C 1287 nt15.33■□□□□ 0.05
MMS22Q06164 HSP60YLR259C 1719 nt15.33■□□□□ 0.05
MMS22Q06164 ATG15YCR068W 1563 nt15.33■□□□□ 0.04
MMS22Q06164 RTN2YDL204W 1182 nt15.33■□□□□ 0.04
MMS22Q06164 YKR005CYKR005C 1578 nt15.31■□□□□ 0.04
MMS22Q06164 MET28YIR017C 564 nt15.31■□□□□ 0.04
MMS22Q06164 NAP1YKR048C 1254 nt15.27■□□□□ 0.04
MMS22Q06164 YML089CYML089C 369 nt15.27■□□□□ 0.03
MMS22Q06164 GND1YHR183W 1470 nt15.25■□□□□ 0.03
MMS22Q06164 YGR259CYGR259C 441 nt15.25■□□□□ 0.03
MMS22Q06164 APT2YDR441C 546 nt15.24■□□□□ 0.03
MMS22Q06164 PLB1YMR008C 1995 nt15.23■□□□□ 0.03
MMS22Q06164 ARP6YLR085C 1317 nt15.17■□□□□ 0.02
MMS22Q06164 FIT3YOR383C 615 nt15.16■□□□□ 0.02
MMS22Q06164 ZTA1YBR046C 1005 nt15.14■□□□□ 0.01
MMS22Q06164 PGC1YPL206C 966 nt15.14■□□□□ 0.01
MMS22Q06164 PRP4YPR178W 1398 nt15.14■□□□□ 0.01
MMS22Q06164 RIB2YOL066C 1776 nt15.13■□□□□ 0.01
MMS22Q06164 PAU5YFL020C 369 nt15.13■□□□□ 0.01
MMS22Q06164 LSC2YGR244C 1284 nt15.13■□□□□ 0.01
MMS22Q06164 GAP1YKR039W 1809 nt15.12■□□□□ 0.01
MMS22Q06164 LSB3YFR024C-A 1380 nt15.09■□□□□ 0.01
MMS22Q06164 DPS1YLL018C 1674 nt15.07■□□□□ 0
MMS22Q06164 YJR114WYJR114W 393 nt15.07■□□□□ 0
MMS22Q06164 BMT6YLR063W 1098 nt15.07■□□□□ 0
MMS22Q06164 UTR1YJR049C 1593 nt15.06■□□□□ 0
MMS22Q06164 PRM5YIL117C 957 nt15.06■□□□□ 0
MMS22Q06164 SMM1YNR015W 1155 nt15.06■□□□□ 0
MMS22Q06164 BOR1YNL275W 1731 nt15.05■□□□□ 0
MMS22Q06164 AKR2YOR034C 2250 nt15.05■□□□□ -0
MMS22Q06164 YJL064WYJL064W 396 nt15.02■□□□□ -0
MMS22Q06164 YBR232CYBR232C 360 nt15.02■□□□□ -0
MMS22Q06164 DIF1YLR437C 402 nt14.99□□□□□ -0.01
MMS22Q06164 SNF1YDR477W 1902 nt14.97□□□□□ -0.01
MMS22Q06164 PAU19YMR325W 375 nt14.97□□□□□ -0.01
MMS22Q06164 SLG1YOR008C 1137 nt14.96□□□□□ -0.01
MMS22Q06164 ALD4YOR374W 1560 nt14.94□□□□□ -0.02
MMS22Q06164 PRY1YJL079C 900 nt14.91□□□□□ -0.02
MMS22Q06164 YAR028WYAR028W 705 nt14.9□□□□□ -0.02
MMS22Q06164 YJL055WYJL055W 738 nt14.89□□□□□ -0.03
MMS22Q06164 TIM44YIL022W 1296 nt14.85□□□□□ -0.03
MMS22Q06164 FCY21YER060W 1587 nt14.83□□□□□ -0.03
MMS22Q06164 ALP1YNL270C 1722 nt14.83□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 VRG4YGL225W 1014 nt14.82□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 UGA4YDL210W 1716 nt14.82□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 STP3YLR375W 1032 nt14.82□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 HXT12YIL170W 1374 nt14.81□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 MTG2YHR168W 1557 nt14.8□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 YER190C-AYER190C-A 576 nt14.77□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt14.77□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 YML133W-AYML133W-A 576 nt14.77□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt14.77□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 TIP1YBR067C 633 nt14.77□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt14.77□□□□□ -0.04
MMS22Q06164 BIO5YNR056C 1686 nt14.74□□□□□ -0.05
MMS22Q06164 IRC24YIR036C 792 nt14.74□□□□□ -0.05
MMS22Q06164 SAM35YHR083W 990 nt14.73□□□□□ -0.05
MMS22Q06164 ERG6YML008C 1152 nt14.73□□□□□ -0.05
MMS22Q06164 SED1YDR077W 1017 nt14.72□□□□□ -0.05
MMS22Q06164 THI72YOR192C 1800 nt14.71□□□□□ -0.05
MMS22Q06164 CCT5YJR064W 1689 nt14.71□□□□□ -0.06
MMS22Q06164 RIB1YBL033C 1038 nt14.68□□□□□ -0.06
MMS22Q06164 YPL251WYPL251W 303 nt14.66□□□□□ -0.06
MMS22Q06164 HIF1YLL022C 1158 nt14.64□□□□□ -0.07
MMS22Q06164 YBL086CYBL086C 1401 nt14.61□□□□□ -0.07
MMS22Q06164 SOD2YHR008C 702 nt14.61□□□□□ -0.07
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