Protein–RNA interactions for Protein: Q02959

HOS3, Histone deacetylase HOS3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOS3Q02959 SAM35YHR083W 990 nt10.76□□□□□ -0.69
HOS3Q02959 GAP1YKR039W 1809 nt10.75□□□□□ -0.69
HOS3Q02959 YSP3YOR003W 1437 nt10.75□□□□□ -0.69
HOS3Q02959 MAE1YKL029C 2010 nt10.72□□□□□ -0.69
HOS3Q02959 YNL024CYNL024C 741 nt10.7□□□□□ -0.7
HOS3Q02959 LSC2YGR244C 1284 nt10.69□□□□□ -0.7
HOS3Q02959 ILV3YJR016C 1758 nt10.67□□□□□ -0.7
HOS3Q02959 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.67□□□□□ -0.7
HOS3Q02959 TIR3YIL011W 810 nt10.67□□□□□ -0.7
HOS3Q02959 YOR325WYOR325W 474 nt10.67□□□□□ -0.7
HOS3Q02959 SHH4YLR164W 507 nt10.66□□□□□ -0.7
HOS3Q02959 PRO1YDR300C 1287 nt10.65□□□□□ -0.7
HOS3Q02959 DBP1YPL119C 1854 nt10.63□□□□□ -0.71
HOS3Q02959 HXT1YHR094C 1713 nt10.61□□□□□ -0.71
HOS3Q02959 SHY1YGR112W 1170 nt10.59□□□□□ -0.71
HOS3Q02959 SBA1YKL117W 651 nt10.59□□□□□ -0.71
HOS3Q02959 YMR209CYMR209C 1374 nt10.59□□□□□ -0.71
HOS3Q02959 YNL115CYNL115C 1935 nt10.58□□□□□ -0.72
HOS3Q02959 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.57□□□□□ -0.72
HOS3Q02959 POM34YLR018C 900 nt10.56□□□□□ -0.72
HOS3Q02959 ATG15YCR068W 1563 nt10.56□□□□□ -0.72
HOS3Q02959 ACO2YJL200C 2370 nt10.55□□□□□ -0.72
HOS3Q02959 COQ8YGL119W 1506 nt10.55□□□□□ -0.72
HOS3Q02959 DIF1YLR437C 402 nt10.55□□□□□ -0.72
HOS3Q02959 UGP1YKL035W 1500 nt10.54□□□□□ -0.72
HOS3Q02959 HIS2YFR025C 1008 nt10.53□□□□□ -0.72
HOS3Q02959 OPI10YOL032W 741 nt10.5□□□□□ -0.73
HOS3Q02959 ARO8YGL202W 1503 nt10.49□□□□□ -0.73
HOS3Q02959 MET2YNL277W 1461 nt10.48□□□□□ -0.73
HOS3Q02959 RET2YFR051C 1641 nt10.47□□□□□ -0.73
HOS3Q02959 PEX25YPL112C 1185 nt10.47□□□□□ -0.73
HOS3Q02959 YBL086CYBL086C 1401 nt10.47□□□□□ -0.73
HOS3Q02959 CWC15YDR163W 528 nt10.46□□□□□ -0.73
HOS3Q02959 YML089CYML089C 369 nt10.46□□□□□ -0.73
HOS3Q02959 VPS75YNL246W 795 nt10.46□□□□□ -0.73
HOS3Q02959 CCT2YIL142W 1584 nt10.46□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 MRP20YDR405W 792 nt10.44□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 KES1YPL145C 1305 nt10.43□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 RRT5YFR032C 870 nt10.43□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 PAU16YKL224C 372 nt10.43□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 BET2YPR176C 978 nt10.43□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 SGA1YIL099W 1650 nt10.42□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.41□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.41□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 URA6YKL024C 615 nt10.41□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.41□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 LIP1YMR298W 453 nt10.41□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.41□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 TOM6YOR045W 186 nt10.41□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.41□□□□□ -0.74
HOS3Q02959 SFP1YLR403W 2052 nt10.39□□□□□ -0.75
HOS3Q02959 LSB6YJL100W 1824 nt10.38□□□□□ -0.75
HOS3Q02959 YFL066CYFL066C 1179 nt10.38□□□□□ -0.75
HOS3Q02959 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.38□□□□□ -0.75
HOS3Q02959 UFO1YML088W 2007 nt10.38□□□□□ -0.75
HOS3Q02959 SFA1YDL168W 1161 nt10.37□□□□□ -0.75
HOS3Q02959 YFR018CYFR018C 1092 nt10.36□□□□□ -0.75
HOS3Q02959 PSD1YNL169C 1503 nt10.36□□□□□ -0.75
HOS3Q02959 SED1YDR077W 1017 nt10.35□□□□□ -0.75
HOS3Q02959 ZAP1YJL056C 2643 nt10.33□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 TIF6YPR016C 738 nt10.32□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 RSC8YFR037C 1674 nt10.31□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 YAR028WYAR028W 705 nt10.31□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 SAM1YLR180W 1149 nt10.31□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 PRE6YOL038W 765 nt10.31□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 ZTA1YBR046C 1005 nt10.31□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 LEU9YOR108W 1815 nt10.3□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 YHL008CYHL008C 1884 nt10.3□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 YDR010CYDR010C 333 nt10.3□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 PAU7YAR020C 168 nt10.3□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 OYE3YPL171C 1203 nt10.3□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 PEX2YJL210W 816 nt10.29□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 TOA2YKL058W 369 nt10.28□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 PET8YNL003C 855 nt10.28□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 DMA2YNL116W 1569 nt10.27□□□□□ -0.76
HOS3Q02959 RPM1RPM1 483 nt10.27□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 MTG2YHR168W 1557 nt10.26□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 ACH1YBL015W 1581 nt10.26□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 CYT1YOR065W 930 nt10.26□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 BRR1YPR057W 1026 nt10.26□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 UGA4YDL210W 1716 nt10.25□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 SHB17YKR043C 816 nt10.25□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 YPL251WYPL251W 303 nt10.25□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 TPO4YOR273C 1980 nt10.25□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 SPP2YOR148C 558 nt10.24□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 QDR2YIL121W 1629 nt10.24□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 FMS1YMR020W 1527 nt10.23□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 HMG2YLR450W 3138 nt10.23□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 GND2YGR256W 1479 nt10.23□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 HIP1YGR191W 1812 nt10.22□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 ODC1YPL134C 933 nt10.21□□□□□ -0.77
HOS3Q02959 CSM2YIL132C 642 nt10.2□□□□□ -0.78
HOS3Q02959 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.19□□□□□ -0.78
HOS3Q02959 GID8YMR135C 1368 nt10.18□□□□□ -0.78
HOS3Q02959 AKR2YOR034C 2250 nt10.17□□□□□ -0.78
HOS3Q02959 VPS62YGR141W 1404 nt10.16□□□□□ -0.78
HOS3Q02959 YHR218WYHR218W 1812 nt10.16□□□□□ -0.78
HOS3Q02959 FLR1YBR008C 1647 nt10.15□□□□□ -0.78
HOS3Q02959 MET28YIR017C 564 nt10.15□□□□□ -0.78
HOS3Q02959 NAT4YMR069W 858 nt10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms