Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NMUP48645 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NMUP48645 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NMUP48645 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NMUP48645 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NMUP48645 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NMUP48645 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NMUP48645 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NMUP48645 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NMUP48645 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NMUP48645 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMUP48645 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMUP48645 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NMUP48645 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMUP48645 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMUP48645 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NMUP48645 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NMUP48645 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NMUP48645 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMUP48645 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMUP48645 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMUP48645 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NMUP48645 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NMUP48645 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NMUP48645 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMUP48645 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMUP48645 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NMUP48645 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NMUP48645 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMUP48645 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMUP48645 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMUP48645 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMUP48645 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMUP48645 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NMUP48645 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMUP48645 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NMUP48645 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMUP48645 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMUP48645 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMUP48645 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMUP48645 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMUP48645 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMUP48645 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMUP48645 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMUP48645 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMUP48645 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMUP48645 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMUP48645 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMUP48645 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMUP48645 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMUP48645 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMUP48645 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NMUP48645 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMUP48645 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMUP48645 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMUP48645 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMUP48645 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMUP48645 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMUP48645 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMUP48645 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMUP48645 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMUP48645 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NMUP48645 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMUP48645 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMUP48645 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMUP48645 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMUP48645 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMUP48645 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMUP48645 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMUP48645 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NMUP48645 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMUP48645 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMUP48645 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMUP48645 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMUP48645 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMUP48645 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMUP48645 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NMUP48645 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMUP48645 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMUP48645 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMUP48645 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NMUP48645 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMUP48645 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMUP48645 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMUP48645 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMUP48645 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMUP48645 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMUP48645 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMUP48645 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMUP48645 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMUP48645 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMUP48645 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMUP48645 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMUP48645 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMUP48645 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NMUP48645 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMUP48645 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMUP48645 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NMUP48645 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NMUP48645 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms