Protein–RNA interactions for Protein: P47082

AVT1, Vacuolar amino acid transporter 1, yeastyeast

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT1P47082 YMR226CYMR226C 804 nt10.78□□□□□ -0.68
AVT1P47082 ARP6YLR085C 1317 nt10.78□□□□□ -0.68
AVT1P47082 CLB6YGR109C 1143 nt10.77□□□□□ -0.69
AVT1P47082 UTH1YKR042W 1098 nt10.77□□□□□ -0.69
AVT1P47082 YML089CYML089C 369 nt10.76□□□□□ -0.69
AVT1P47082 TIF6YPR016C 738 nt10.75□□□□□ -0.69
AVT1P47082 CAB5YDR196C 726 nt10.74□□□□□ -0.69
AVT1P47082 ATG15YCR068W 1563 nt10.73□□□□□ -0.69
AVT1P47082 RTN2YDL204W 1182 nt10.72□□□□□ -0.69
AVT1P47082 SDH5YOL071W 489 nt10.72□□□□□ -0.69
AVT1P47082 YLR111WYLR111W 333 nt10.71□□□□□ -0.69
AVT1P47082 PLB1YMR008C 1995 nt10.71□□□□□ -0.69
AVT1P47082 NRT1YOR071C 1797 nt10.71□□□□□ -0.69
AVT1P47082 GAP1YKR039W 1809 nt10.69□□□□□ -0.7
AVT1P47082 YJL225CYJL225C 5277 nt10.67□□□□□ -0.7
AVT1P47082 MET28YIR017C 564 nt10.67□□□□□ -0.7
AVT1P47082 TSC10YBR265W 963 nt10.67□□□□□ -0.7
AVT1P47082 YKR005CYKR005C 1578 nt10.67□□□□□ -0.7
AVT1P47082 RAD23YEL037C 1197 nt10.66□□□□□ -0.7
AVT1P47082 YGR012WYGR012W 1182 nt10.66□□□□□ -0.7
AVT1P47082 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.66□□□□□ -0.7
AVT1P47082 HSP60YLR259C 1719 nt10.66□□□□□ -0.7
AVT1P47082 YGR259CYGR259C 441 nt10.63□□□□□ -0.71
AVT1P47082 YLR279WYLR279W 390 nt10.63□□□□□ -0.71
AVT1P47082 SAM1YLR180W 1149 nt10.62□□□□□ -0.71
AVT1P47082 MSB4YOL112W 1479 nt10.59□□□□□ -0.71
AVT1P47082 PRP4YPR178W 1398 nt10.58□□□□□ -0.72
AVT1P47082 UTR1YJR049C 1593 nt10.57□□□□□ -0.72
AVT1P47082 RIB3YDR487C 627 nt10.57□□□□□ -0.72
AVT1P47082 DIF1YLR437C 402 nt10.56□□□□□ -0.72
AVT1P47082 FIT3YOR383C 615 nt10.55□□□□□ -0.72
AVT1P47082 DPS1YLL018C 1674 nt10.53□□□□□ -0.72
AVT1P47082 ZTA1YBR046C 1005 nt10.53□□□□□ -0.72
AVT1P47082 MTG2YHR168W 1557 nt10.49□□□□□ -0.73
AVT1P47082 YAR028WYAR028W 705 nt10.49□□□□□ -0.73
AVT1P47082 PRM5YIL117C 957 nt10.45□□□□□ -0.74
AVT1P47082 BMT6YLR063W 1098 nt10.45□□□□□ -0.74
AVT1P47082 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.45□□□□□ -0.74
AVT1P47082 NVJ2YPR091C 2313 nt10.45□□□□□ -0.74
AVT1P47082 ALP1YNL270C 1722 nt10.44□□□□□ -0.74
AVT1P47082 RAD51YER095W 1203 nt10.44□□□□□ -0.74
AVT1P47082 BOR1YNL275W 1731 nt10.44□□□□□ -0.74
AVT1P47082 AKR2YOR034C 2250 nt10.44□□□□□ -0.74
AVT1P47082 SNF1YDR477W 1902 nt10.43□□□□□ -0.74
AVT1P47082 IRC24YIR036C 792 nt10.4□□□□□ -0.74
AVT1P47082 GND1YHR183W 1470 nt10.38□□□□□ -0.75
AVT1P47082 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.37□□□□□ -0.75
AVT1P47082 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.37□□□□□ -0.75
AVT1P47082 LOT5YKL183W 921 nt10.37□□□□□ -0.75
AVT1P47082 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.37□□□□□ -0.75
AVT1P47082 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.37□□□□□ -0.75
AVT1P47082 ADH1YOL086C 1047 nt10.37□□□□□ -0.75
AVT1P47082 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.37□□□□□ -0.75
AVT1P47082 AAC1YMR056C 930 nt10.34□□□□□ -0.75
AVT1P47082 FCY21YER060W 1587 nt10.34□□□□□ -0.75
AVT1P47082 YLR349WYLR349W 507 nt10.33□□□□□ -0.76
AVT1P47082 YNR029CYNR029C 1290 nt10.33□□□□□ -0.76
AVT1P47082 SED1YDR077W 1017 nt10.32□□□□□ -0.76
AVT1P47082 YPI1YFR003C 468 nt10.32□□□□□ -0.76
AVT1P47082 SAM35YHR083W 990 nt10.32□□□□□ -0.76
AVT1P47082 FUN14YAL008W 597 nt10.31□□□□□ -0.76
AVT1P47082 YJL195CYJL195C 702 nt10.31□□□□□ -0.76
AVT1P47082 SMM1YNR015W 1155 nt10.31□□□□□ -0.76
AVT1P47082 UGA4YDL210W 1716 nt10.3□□□□□ -0.76
AVT1P47082 STE4YOR212W 1272 nt10.3□□□□□ -0.76
AVT1P47082 DBP1YPL119C 1854 nt10.3□□□□□ -0.76
AVT1P47082 APT2YDR441C 546 nt10.29□□□□□ -0.76
AVT1P47082 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.28□□□□□ -0.76
AVT1P47082 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.28□□□□□ -0.76
AVT1P47082 LIP1YMR298W 453 nt10.26□□□□□ -0.77
AVT1P47082 YPL251WYPL251W 303 nt10.26□□□□□ -0.77
AVT1P47082 ALD4YOR374W 1560 nt10.25□□□□□ -0.77
AVT1P47082 YBL086CYBL086C 1401 nt10.24□□□□□ -0.77
AVT1P47082 HIF1YLL022C 1158 nt10.24□□□□□ -0.77
AVT1P47082 BIO5YNR056C 1686 nt10.24□□□□□ -0.77
AVT1P47082 PRY1YJL079C 900 nt10.23□□□□□ -0.77
AVT1P47082 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.2□□□□□ -0.78
AVT1P47082 HXT1YHR094C 1713 nt10.2□□□□□ -0.78
AVT1P47082 RIB2YOL066C 1776 nt10.2□□□□□ -0.78
AVT1P47082 LEU9YOR108W 1815 nt10.19□□□□□ -0.78
AVT1P47082 HXT12YIL170W 1374 nt10.18□□□□□ -0.78
AVT1P47082 YEL008WYEL008W 381 nt10.17□□□□□ -0.78
AVT1P47082 ADH7YCR105W 1086 nt10.16□□□□□ -0.78
AVT1P47082 BRR1YPR057W 1026 nt10.16□□□□□ -0.78
AVT1P47082 YMR103CYMR103C 363 nt10.14□□□□□ -0.79
AVT1P47082 MEP3YPR138C 1470 nt10.14□□□□□ -0.79
AVT1P47082 PAU15YIR041W 375 nt10.12□□□□□ -0.79
AVT1P47082 YJL055WYJL055W 738 nt10.12□□□□□ -0.79
AVT1P47082 GPN2YOR262W 1044 nt10.12□□□□□ -0.79
AVT1P47082 CSM1YCR086W 573 nt10.11□□□□□ -0.79
AVT1P47082 TOA2YKL058W 369 nt10.11□□□□□ -0.79
AVT1P47082 ALG12YNR030W 1656 nt10.11□□□□□ -0.79
AVT1P47082 VRG4YGL225W 1014 nt10.1□□□□□ -0.79
AVT1P47082 SHY1YGR112W 1170 nt10.1□□□□□ -0.79
AVT1P47082 Q0182Q0182 405 nt10.1□□□□□ -0.79
AVT1P47082 UFO1YML088W 2007 nt10.1□□□□□ -0.79
AVT1P47082 GND2YGR256W 1479 nt10.06□□□□□ -0.8
AVT1P47082 CPD1YGR247W 720 nt10.05□□□□□ -0.8
AVT1P47082 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.05□□□□□ -0.8
AVT1P47082 SSN3YPL042C 1668 nt10.04□□□□□ -0.8
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