Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 POM34YLR018C 900 nt10.19□□□□□ -0.78
UFE1P41834 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.19□□□□□ -0.78
UFE1P41834 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.19□□□□□ -0.78
UFE1P41834 YML089CYML089C 369 nt10.18□□□□□ -0.78
UFE1P41834 TOM6YOR045W 186 nt10.18□□□□□ -0.78
UFE1P41834 SDH5YOL071W 489 nt10.16□□□□□ -0.78
UFE1P41834 HIP1YGR191W 1812 nt10.15□□□□□ -0.78
UFE1P41834 RAD23YEL037C 1197 nt10.13□□□□□ -0.79
UFE1P41834 PEX2YJL210W 816 nt10.13□□□□□ -0.79
UFE1P41834 PRO1YDR300C 1287 nt10.12□□□□□ -0.79
UFE1P41834 SAM1YLR180W 1149 nt10.11□□□□□ -0.79
UFE1P41834 TSC10YBR265W 963 nt10.11□□□□□ -0.79
UFE1P41834 NRT1YOR071C 1797 nt10.1□□□□□ -0.79
UFE1P41834 ARP6YLR085C 1317 nt10.09□□□□□ -0.79
UFE1P41834 MET28YIR017C 564 nt10.08□□□□□ -0.8
UFE1P41834 TIF6YPR016C 738 nt10.08□□□□□ -0.8
UFE1P41834 ATG15YCR068W 1563 nt10.08□□□□□ -0.8
UFE1P41834 FUR4YBR021W 1902 nt10.07□□□□□ -0.8
UFE1P41834 RPM1RPM1 483 nt10.07□□□□□ -0.8
UFE1P41834 RTN2YDL204W 1182 nt10.06□□□□□ -0.8
UFE1P41834 YGR012WYGR012W 1182 nt10.05□□□□□ -0.8
UFE1P41834 BOR1YNL275W 1731 nt10.04□□□□□ -0.8
UFE1P41834 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.03□□□□□ -0.8
UFE1P41834 GAP1YKR039W 1809 nt10.01□□□□□ -0.81
UFE1P41834 FIT3YOR383C 615 nt10.01□□□□□ -0.81
UFE1P41834 RIB3YDR487C 627 nt10□□□□□ -0.81
UFE1P41834 YLR279WYLR279W 390 nt9.99□□□□□ -0.81
UFE1P41834 MCH5YOR306C 1566 nt9.98□□□□□ -0.81
UFE1P41834 CAB5YDR196C 726 nt9.97□□□□□ -0.81
UFE1P41834 PLB1YMR008C 1995 nt9.96□□□□□ -0.81
UFE1P41834 MSB4YOL112W 1479 nt9.92□□□□□ -0.82
UFE1P41834 YKR005CYKR005C 1578 nt9.9□□□□□ -0.82
UFE1P41834 YGR259CYGR259C 441 nt9.9□□□□□ -0.82
UFE1P41834 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.9□□□□□ -0.82
UFE1P41834 DIF1YLR437C 402 nt9.88□□□□□ -0.83
UFE1P41834 YAR028WYAR028W 705 nt9.87□□□□□ -0.83
UFE1P41834 ALP1YNL270C 1722 nt9.84□□□□□ -0.83
UFE1P41834 UTR1YJR049C 1593 nt9.84□□□□□ -0.83
UFE1P41834 PRP4YPR178W 1398 nt9.83□□□□□ -0.84
UFE1P41834 HSP60YLR259C 1719 nt9.82□□□□□ -0.84
UFE1P41834 RAD51YER095W 1203 nt9.81□□□□□ -0.84
UFE1P41834 YPI1YFR003C 468 nt9.81□□□□□ -0.84
UFE1P41834 GND1YHR183W 1470 nt9.8□□□□□ -0.84
UFE1P41834 FUN14YAL008W 597 nt9.8□□□□□ -0.84
UFE1P41834 STE4YOR212W 1272 nt9.8□□□□□ -0.84
UFE1P41834 ZTA1YBR046C 1005 nt9.8□□□□□ -0.84
UFE1P41834 AKR2YOR034C 2250 nt9.8□□□□□ -0.84
UFE1P41834 MTG2YHR168W 1557 nt9.8□□□□□ -0.84
UFE1P41834 YJL195CYJL195C 702 nt9.79□□□□□ -0.84
UFE1P41834 LOT5YKL183W 921 nt9.78□□□□□ -0.84
UFE1P41834 BMT6YLR063W 1098 nt9.78□□□□□ -0.84
UFE1P41834 ADH1YOL086C 1047 nt9.78□□□□□ -0.84
UFE1P41834 SAM35YHR083W 990 nt9.77□□□□□ -0.85
UFE1P41834 YLR349WYLR349W 507 nt9.77□□□□□ -0.85
UFE1P41834 DPS1YLL018C 1674 nt9.75□□□□□ -0.85
UFE1P41834 YNR029CYNR029C 1290 nt9.72□□□□□ -0.85
UFE1P41834 IRC24YIR036C 792 nt9.71□□□□□ -0.86
UFE1P41834 FCY21YER060W 1587 nt9.71□□□□□ -0.86
UFE1P41834 SED1YDR077W 1017 nt9.69□□□□□ -0.86
UFE1P41834 PRM5YIL117C 957 nt9.69□□□□□ -0.86
UFE1P41834 AAC1YMR056C 930 nt9.69□□□□□ -0.86
UFE1P41834 APT2YDR441C 546 nt9.68□□□□□ -0.86
UFE1P41834 SMM1YNR015W 1155 nt9.68□□□□□ -0.86
UFE1P41834 ADH7YCR105W 1086 nt9.66□□□□□ -0.86
UFE1P41834 YEL008WYEL008W 381 nt9.66□□□□□ -0.86
UFE1P41834 ALG12YNR030W 1656 nt9.64□□□□□ -0.87
UFE1P41834 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.64□□□□□ -0.87
UFE1P41834 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.63□□□□□ -0.87
UFE1P41834 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.63□□□□□ -0.87
UFE1P41834 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.63□□□□□ -0.87
UFE1P41834 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.63□□□□□ -0.87
UFE1P41834 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.63□□□□□ -0.87
UFE1P41834 LIP1YMR298W 453 nt9.62□□□□□ -0.87
UFE1P41834 Q0182Q0182 405 nt9.61□□□□□ -0.87
UFE1P41834 PAU15YIR041W 375 nt9.61□□□□□ -0.87
UFE1P41834 UGA4YDL210W 1716 nt9.6□□□□□ -0.87
UFE1P41834 PRY1YJL079C 900 nt9.6□□□□□ -0.87
UFE1P41834 HXT12YIL170W 1374 nt9.59□□□□□ -0.87
UFE1P41834 DBP1YPL119C 1854 nt9.59□□□□□ -0.87
UFE1P41834 ALD4YOR374W 1560 nt9.58□□□□□ -0.88
UFE1P41834 RIB2YOL066C 1776 nt9.58□□□□□ -0.88
UFE1P41834 CPD1YGR247W 720 nt9.57□□□□□ -0.88
UFE1P41834 SNF1YDR477W 1902 nt9.56□□□□□ -0.88
UFE1P41834 GPN2YOR262W 1044 nt9.56□□□□□ -0.88
UFE1P41834 YPL251WYPL251W 303 nt9.55□□□□□ -0.88
UFE1P41834 HXT1YHR094C 1713 nt9.55□□□□□ -0.88
UFE1P41834 YBL086CYBL086C 1401 nt9.54□□□□□ -0.88
UFE1P41834 VRG4YGL225W 1014 nt9.53□□□□□ -0.88
UFE1P41834 LEU9YOR108W 1815 nt9.52□□□□□ -0.89
UFE1P41834 BRR1YPR057W 1026 nt9.51□□□□□ -0.89
UFE1P41834 HIF1YLL022C 1158 nt9.5□□□□□ -0.89
UFE1P41834 MEP3YPR138C 1470 nt9.49□□□□□ -0.89
UFE1P41834 ESS1YJR017C 513 nt9.48□□□□□ -0.89
UFE1P41834 YJL055WYJL055W 738 nt9.46□□□□□ -0.9
UFE1P41834 TOA2YKL058W 369 nt9.46□□□□□ -0.9
UFE1P41834 YMR103CYMR103C 363 nt9.46□□□□□ -0.9
UFE1P41834 CSM1YCR086W 573 nt9.45□□□□□ -0.9
UFE1P41834 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.45□□□□□ -0.9
UFE1P41834 LSB5YCL034W 1065 nt9.42□□□□□ -0.9
UFE1P41834 SHY1YGR112W 1170 nt9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.8 ms