Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 POM34YLR018C 900 nt11.45□□□□□ -0.58
YBL028CP38202 PEX2YJL210W 816 nt11.44□□□□□ -0.58
YBL028CP38202 YJL225CYJL225C 5277 nt11.43□□□□□ -0.58
YBL028CP38202 TSC10YBR265W 963 nt11.43□□□□□ -0.58
YBL028CP38202 RIB3YDR487C 627 nt11.42□□□□□ -0.58
YBL028CP38202 YGR012WYGR012W 1182 nt11.42□□□□□ -0.58
YBL028CP38202 YML089CYML089C 369 nt11.4□□□□□ -0.58
YBL028CP38202 NRT1YOR071C 1797 nt11.4□□□□□ -0.58
YBL028CP38202 STR3YGL184C 1398 nt11.4□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 LSC2YGR244C 1284 nt11.38□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 PRO1YDR300C 1287 nt11.37□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 STE4YOR212W 1272 nt11.37□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 DUS1YML080W 1272 nt11.36□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 MET28YIR017C 564 nt11.35□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 YLR349WYLR349W 507 nt11.35□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 YNR029CYNR029C 1290 nt11.35□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 TIF6YPR016C 738 nt11.35□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 AQY2YLL052C 450 nt11.34□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 RPM1RPM1 483 nt11.34□□□□□ -0.59
YBL028CP38202 YLR279WYLR279W 390 nt11.33□□□□□ -0.6
YBL028CP38202 FUN14YAL008W 597 nt11.32□□□□□ -0.6
YBL028CP38202 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.32□□□□□ -0.6
YBL028CP38202 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.32□□□□□ -0.6
YBL028CP38202 YJL195CYJL195C 702 nt11.29□□□□□ -0.6
YBL028CP38202 ATG15YCR068W 1563 nt11.28□□□□□ -0.6
YBL028CP38202 YCL074WYCL074W 927 nt11.27□□□□□ -0.61
YBL028CP38202 MSB4YOL112W 1479 nt11.26□□□□□ -0.61
YBL028CP38202 ADH1YOL086C 1047 nt11.25□□□□□ -0.61
YBL028CP38202 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.25□□□□□ -0.61
YBL028CP38202 ARP6YLR085C 1317 nt11.25□□□□□ -0.61
YBL028CP38202 FIT3YOR383C 615 nt11.23□□□□□ -0.61
YBL028CP38202 ADH7YCR105W 1086 nt11.21□□□□□ -0.61
YBL028CP38202 PAU15YIR041W 375 nt11.19□□□□□ -0.62
YBL028CP38202 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.19□□□□□ -0.62
YBL028CP38202 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.19□□□□□ -0.62
YBL028CP38202 YPI1YFR003C 468 nt11.18□□□□□ -0.62
YBL028CP38202 GAP1YKR039W 1809 nt11.17□□□□□ -0.62
YBL028CP38202 GND1YHR183W 1470 nt11.13□□□□□ -0.63
YBL028CP38202 YEL008WYEL008W 381 nt11.12□□□□□ -0.63
YBL028CP38202 LOT5YKL183W 921 nt11.11□□□□□ -0.63
YBL028CP38202 GPN2YOR262W 1044 nt11.09□□□□□ -0.63
YBL028CP38202 AAC1YMR056C 930 nt11.08□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 PLB1YMR008C 1995 nt11.08□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 RTN2YDL204W 1182 nt11.07□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 CPD1YGR247W 720 nt11.05□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 DIF1YLR437C 402 nt11.05□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 ALP1YNL270C 1722 nt11.04□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 FUR4YBR021W 1902 nt11.03□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 APT2YDR441C 546 nt11.03□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 YAR028WYAR028W 705 nt11.03□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 ZTA1YBR046C 1005 nt11.03□□□□□ -0.64
YBL028CP38202 ESS1YJR017C 513 nt11.01□□□□□ -0.65
YBL028CP38202 SMM1YNR015W 1155 nt11.01□□□□□ -0.65
YBL028CP38202 MTG2YHR168W 1557 nt11.01□□□□□ -0.65
YBL028CP38202 AKR2YOR034C 2250 nt10.98□□□□□ -0.65
YBL028CP38202 FCY21YER060W 1587 nt10.97□□□□□ -0.65
YBL028CP38202 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.96□□□□□ -0.65
YBL028CP38202 UTR1YJR049C 1593 nt10.95□□□□□ -0.66
YBL028CP38202 UME6YDR207C 2511 nt10.95□□□□□ -0.66
YBL028CP38202 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.92□□□□□ -0.66
YBL028CP38202 RIB2YOL066C 1776 nt10.92□□□□□ -0.66
YBL028CP38202 HXT12YIL170W 1374 nt10.88□□□□□ -0.67
YBL028CP38202 YGR259CYGR259C 441 nt10.87□□□□□ -0.67
YBL028CP38202 YKR005CYKR005C 1578 nt10.86□□□□□ -0.67
YBL028CP38202 PRY1YJL079C 900 nt10.83□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 UGA4YDL210W 1716 nt10.82□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.81□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.81□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 SEN2YLR105C 1134 nt10.81□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.81□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.81□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.81□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 VRG4YGL225W 1014 nt10.8□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 SED1YDR077W 1017 nt10.79□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 NAP1YKR048C 1254 nt10.79□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 PUP1YOR157C 786 nt10.79□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 PGC1YPL206C 966 nt10.78□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 ALD4YOR374W 1560 nt10.77□□□□□ -0.68
YBL028CP38202 SAM35YHR083W 990 nt10.76□□□□□ -0.69
YBL028CP38202 YBR232CYBR232C 360 nt10.75□□□□□ -0.69
YBL028CP38202 PRM5YIL117C 957 nt10.74□□□□□ -0.69
YBL028CP38202 YJL055WYJL055W 738 nt10.74□□□□□ -0.69
YBL028CP38202 PAU5YFL020C 369 nt10.73□□□□□ -0.69
YBL028CP38202 PRP4YPR178W 1398 nt10.73□□□□□ -0.69
YBL028CP38202 LIP1YMR298W 453 nt10.72□□□□□ -0.69
YBL028CP38202 CCT5YJR064W 1689 nt10.71□□□□□ -0.69
YBL028CP38202 STP3YLR375W 1032 nt10.7□□□□□ -0.7
YBL028CP38202 YPL251WYPL251W 303 nt10.68□□□□□ -0.7
YBL028CP38202 CSM1YCR086W 573 nt10.67□□□□□ -0.7
YBL028CP38202 HSP60YLR259C 1719 nt10.67□□□□□ -0.7
YBL028CP38202 DBP1YPL119C 1854 nt10.66□□□□□ -0.7
YBL028CP38202 DPS1YLL018C 1674 nt10.65□□□□□ -0.7
YBL028CP38202 YJL064WYJL064W 396 nt10.64□□□□□ -0.71
YBL028CP38202 BMT6YLR063W 1098 nt10.63□□□□□ -0.71
YBL028CP38202 LEU9YOR108W 1815 nt10.63□□□□□ -0.71
YBL028CP38202 YBL086CYBL086C 1401 nt10.62□□□□□ -0.71
YBL028CP38202 BRR1YPR057W 1026 nt10.62□□□□□ -0.71
YBL028CP38202 IRC24YIR036C 792 nt10.61□□□□□ -0.71
YBL028CP38202 YMR103CYMR103C 363 nt10.61□□□□□ -0.71
YBL028CP38202 MEP3YPR138C 1470 nt10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.6 ms