Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 HIP1YGR191W 1812 nt13.05□□□□□ -0.32
CSE4P36012 PEX2YJL210W 816 nt13.05□□□□□ -0.32
CSE4P36012 POM34YLR018C 900 nt13.05□□□□□ -0.32
CSE4P36012 YGR012WYGR012W 1182 nt13.02□□□□□ -0.33
CSE4P36012 CSM2YIL132C 642 nt13.02□□□□□ -0.33
CSE4P36012 TSC10YBR265W 963 nt13.02□□□□□ -0.33
CSE4P36012 STR3YGL184C 1398 nt12.99□□□□□ -0.33
CSE4P36012 RIB3YDR487C 627 nt12.99□□□□□ -0.33
CSE4P36012 NRT1YOR071C 1797 nt12.99□□□□□ -0.33
CSE4P36012 YML089CYML089C 369 nt12.97□□□□□ -0.33
CSE4P36012 PRO1YDR300C 1287 nt12.96□□□□□ -0.33
CSE4P36012 DUS1YML080W 1272 nt12.96□□□□□ -0.33
CSE4P36012 AQY2YLL052C 450 nt12.95□□□□□ -0.34
CSE4P36012 STE4YOR212W 1272 nt12.95□□□□□ -0.34
CSE4P36012 LSC2YGR244C 1284 nt12.94□□□□□ -0.34
CSE4P36012 YLR349WYLR349W 507 nt12.94□□□□□ -0.34
CSE4P36012 YNR029CYNR029C 1290 nt12.94□□□□□ -0.34
CSE4P36012 TIF6YPR016C 738 nt12.94□□□□□ -0.34
CSE4P36012 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.93□□□□□ -0.34
CSE4P36012 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.93□□□□□ -0.34
CSE4P36012 MET28YIR017C 564 nt12.92□□□□□ -0.34
CSE4P36012 YLR279WYLR279W 390 nt12.92□□□□□ -0.34
CSE4P36012 RPM1RPM1 483 nt12.91□□□□□ -0.34
CSE4P36012 FUN14YAL008W 597 nt12.88□□□□□ -0.35
CSE4P36012 ATG15YCR068W 1563 nt12.87□□□□□ -0.35
CSE4P36012 MSB4YOL112W 1479 nt12.85□□□□□ -0.35
CSE4P36012 YJL195CYJL195C 702 nt12.85□□□□□ -0.35
CSE4P36012 FUR4YBR021W 1902 nt12.85□□□□□ -0.35
CSE4P36012 YCL074WYCL074W 927 nt12.84□□□□□ -0.35
CSE4P36012 ADH1YOL086C 1047 nt12.82□□□□□ -0.36
CSE4P36012 ARP6YLR085C 1317 nt12.81□□□□□ -0.36
CSE4P36012 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.8□□□□□ -0.36
CSE4P36012 ADH7YCR105W 1086 nt12.79□□□□□ -0.36
CSE4P36012 FIT3YOR383C 615 nt12.78□□□□□ -0.36
CSE4P36012 PAU15YIR041W 375 nt12.76□□□□□ -0.37
CSE4P36012 GAP1YKR039W 1809 nt12.73□□□□□ -0.37
CSE4P36012 YPI1YFR003C 468 nt12.72□□□□□ -0.37
CSE4P36012 HSP60YLR259C 1719 nt12.68□□□□□ -0.38
CSE4P36012 GND1YHR183W 1470 nt12.68□□□□□ -0.38
CSE4P36012 LOT5YKL183W 921 nt12.67□□□□□ -0.38
CSE4P36012 YEL008WYEL008W 381 nt12.65□□□□□ -0.38
CSE4P36012 GPN2YOR262W 1044 nt12.65□□□□□ -0.38
CSE4P36012 PLB1YMR008C 1995 nt12.64□□□□□ -0.39
CSE4P36012 AAC1YMR056C 930 nt12.64□□□□□ -0.39
CSE4P36012 RTN2YDL204W 1182 nt12.63□□□□□ -0.39
CSE4P36012 DIF1YLR437C 402 nt12.6□□□□□ -0.39
CSE4P36012 PAU21YOR394W 495 nt12.6□□□□□ -0.39
CSE4P36012 ZTA1YBR046C 1005 nt12.6□□□□□ -0.39
CSE4P36012 PAU22YPL282C 495 nt12.6□□□□□ -0.39
CSE4P36012 YJL225CYJL225C 5277 nt12.59□□□□□ -0.39
CSE4P36012 APT2YDR441C 546 nt12.58□□□□□ -0.4
CSE4P36012 CPD1YGR247W 720 nt12.58□□□□□ -0.4
CSE4P36012 YKR005CYKR005C 1578 nt12.57□□□□□ -0.4
CSE4P36012 YAR028WYAR028W 705 nt12.57□□□□□ -0.4
CSE4P36012 ALP1YNL270C 1722 nt12.57□□□□□ -0.4
CSE4P36012 SMM1YNR015W 1155 nt12.55□□□□□ -0.4
CSE4P36012 MTG2YHR168W 1557 nt12.55□□□□□ -0.4
CSE4P36012 ESS1YJR017C 513 nt12.54□□□□□ -0.4
CSE4P36012 AKR2YOR034C 2250 nt12.53□□□□□ -0.4
CSE4P36012 PRP4YPR178W 1398 nt12.53□□□□□ -0.4
CSE4P36012 BOR1YNL275W 1731 nt12.51□□□□□ -0.41
CSE4P36012 YGR259CYGR259C 441 nt12.5□□□□□ -0.41
CSE4P36012 UTR1YJR049C 1593 nt12.5□□□□□ -0.41
CSE4P36012 FCY21YER060W 1587 nt12.49□□□□□ -0.41
CSE4P36012 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.48□□□□□ -0.41
CSE4P36012 ARO7YPR060C 771 nt12.48□□□□□ -0.41
CSE4P36012 DPS1YLL018C 1674 nt12.48□□□□□ -0.41
CSE4P36012 RIB2YOL066C 1776 nt12.46□□□□□ -0.42
CSE4P36012 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.45□□□□□ -0.42
CSE4P36012 MET8YBR213W 825 nt12.43□□□□□ -0.42
CSE4P36012 HXT12YIL170W 1374 nt12.39□□□□□ -0.43
CSE4P36012 NVJ2YPR091C 2313 nt12.39□□□□□ -0.43
CSE4P36012 PRY1YJL079C 900 nt12.36□□□□□ -0.43
CSE4P36012 SNF1YDR477W 1902 nt12.36□□□□□ -0.43
CSE4P36012 UGA4YDL210W 1716 nt12.36□□□□□ -0.43
CSE4P36012 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.34□□□□□ -0.43
CSE4P36012 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.34□□□□□ -0.43
CSE4P36012 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.34□□□□□ -0.43
CSE4P36012 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.34□□□□□ -0.43
CSE4P36012 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.34□□□□□ -0.43
CSE4P36012 SEN2YLR105C 1134 nt12.32□□□□□ -0.44
CSE4P36012 VRG4YGL225W 1014 nt12.31□□□□□ -0.44
CSE4P36012 SED1YDR077W 1017 nt12.3□□□□□ -0.44
CSE4P36012 BMT6YLR063W 1098 nt12.3□□□□□ -0.44
CSE4P36012 PUP1YOR157C 786 nt12.3□□□□□ -0.44
CSE4P36012 ALD4YOR374W 1560 nt12.29□□□□□ -0.44
CSE4P36012 IRC24YIR036C 792 nt12.28□□□□□ -0.44
CSE4P36012 PGC1YPL206C 966 nt12.28□□□□□ -0.44
CSE4P36012 PRM5YIL117C 957 nt12.27□□□□□ -0.45
CSE4P36012 YJL055WYJL055W 738 nt12.27□□□□□ -0.45
CSE4P36012 NAP1YKR048C 1254 nt12.27□□□□□ -0.45
CSE4P36012 SAM35YHR083W 990 nt12.25□□□□□ -0.45
CSE4P36012 YBR232CYBR232C 360 nt12.24□□□□□ -0.45
CSE4P36012 PAU5YFL020C 369 nt12.23□□□□□ -0.45
CSE4P36012 LIP1YMR298W 453 nt12.22□□□□□ -0.45
CSE4P36012 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.21□□□□□ -0.45
CSE4P36012 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.21□□□□□ -0.45
CSE4P36012 CCT5YJR064W 1689 nt12.2□□□□□ -0.46
CSE4P36012 YPL251WYPL251W 303 nt12.19□□□□□ -0.46
CSE4P36012 BIO5YNR056C 1686 nt12.19□□□□□ -0.46
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