Protein–RNA interactions for Protein: P35181

APS1, AP-1 complex subunit sigma-1, yeastyeast

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APS1P35181 YRF1-2YER190W 5046 nt7.41□□□□□ -1.22
APS1P35181 LSC2YGR244C 1284 nt7.4□□□□□ -1.22
APS1P35181 ESBP6YNL125C 2022 nt7.39□□□□□ -1.23
APS1P35181 YLR415CYLR415C 339 nt7.39□□□□□ -1.23
APS1P35181 GAP1YKR039W 1809 nt7.38□□□□□ -1.23
APS1P35181 YMR209CYMR209C 1374 nt7.38□□□□□ -1.23
APS1P35181 NIT1YIL164C 600 nt7.38□□□□□ -1.23
APS1P35181 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.37□□□□□ -1.23
APS1P35181 BDH1YAL060W 1149 nt7.36□□□□□ -1.23
APS1P35181 COQ8YGL119W 1506 nt7.35□□□□□ -1.23
APS1P35181 OPI10YOL032W 741 nt7.34□□□□□ -1.23
APS1P35181 HXT1YHR094C 1713 nt7.33□□□□□ -1.24
APS1P35181 SFP1YLR403W 2052 nt7.33□□□□□ -1.24
APS1P35181 TIR3YIL011W 810 nt7.33□□□□□ -1.24
APS1P35181 YOR325WYOR325W 474 nt7.33□□□□□ -1.24
APS1P35181 UGP1YKL035W 1500 nt7.32□□□□□ -1.24
APS1P35181 DBP1YPL119C 1854 nt7.32□□□□□ -1.24
APS1P35181 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.32□□□□□ -1.24
APS1P35181 SGT2YOR007C 1041 nt7.3□□□□□ -1.24
APS1P35181 HEM14YER014W 1620 nt7.3□□□□□ -1.24
APS1P35181 PSD1YNL169C 1503 nt7.29□□□□□ -1.24
APS1P35181 SHY1YGR112W 1170 nt7.29□□□□□ -1.24
APS1P35181 CYT1YOR065W 930 nt7.29□□□□□ -1.24
APS1P35181 YHL008CYHL008C 1884 nt7.29□□□□□ -1.24
APS1P35181 ILV2YMR108W 2064 nt7.29□□□□□ -1.24
APS1P35181 DTR1YBR180W 1719 nt7.28□□□□□ -1.24
APS1P35181 ARO8YGL202W 1503 nt7.27□□□□□ -1.25
APS1P35181 UGA4YDL210W 1716 nt7.27□□□□□ -1.25
APS1P35181 KES1YPL145C 1305 nt7.27□□□□□ -1.25
APS1P35181 SGA1YIL099W 1650 nt7.25□□□□□ -1.25
APS1P35181 CCT2YIL142W 1584 nt7.25□□□□□ -1.25
APS1P35181 CWC15YDR163W 528 nt7.25□□□□□ -1.25
APS1P35181 TPO4YOR273C 1980 nt7.24□□□□□ -1.25
APS1P35181 HMG2YLR450W 3138 nt7.24□□□□□ -1.25
APS1P35181 PRO1YDR300C 1287 nt7.24□□□□□ -1.25
APS1P35181 RTG1YOL067C 534 nt7.24□□□□□ -1.25
APS1P35181 DIF1YLR437C 402 nt7.23□□□□□ -1.25
APS1P35181 YML089CYML089C 369 nt7.23□□□□□ -1.25
APS1P35181 YSP3YOR003W 1437 nt7.23□□□□□ -1.25
APS1P35181 ATG15YCR068W 1563 nt7.22□□□□□ -1.25
APS1P35181 DMA2YNL116W 1569 nt7.22□□□□□ -1.25
APS1P35181 URA6YKL024C 615 nt7.22□□□□□ -1.25
APS1P35181 MRP20YDR405W 792 nt7.21□□□□□ -1.26
APS1P35181 HUA1YGR268C 597 nt7.21□□□□□ -1.26
APS1P35181 POM34YLR018C 900 nt7.2□□□□□ -1.26
APS1P35181 NPP1YCR026C 2229 nt7.2□□□□□ -1.26
APS1P35181 MAS1YLR163C 1389 nt7.2□□□□□ -1.26
APS1P35181 MCM5YLR274W 2328 nt7.19□□□□□ -1.26
APS1P35181 BET2YPR176C 978 nt7.19□□□□□ -1.26
APS1P35181 RSC4YKR008W 1878 nt7.18□□□□□ -1.26
APS1P35181 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.18□□□□□ -1.26
APS1P35181 RSC8YFR037C 1674 nt7.17□□□□□ -1.26
APS1P35181 SHH4YLR164W 507 nt7.17□□□□□ -1.26
APS1P35181 LIP1YMR298W 453 nt7.17□□□□□ -1.26
APS1P35181 YBL086CYBL086C 1401 nt7.16□□□□□ -1.26
APS1P35181 HXK1YFR053C 1458 nt7.16□□□□□ -1.26
APS1P35181 LSB6YJL100W 1824 nt7.15□□□□□ -1.26
APS1P35181 VPS75YNL246W 795 nt7.15□□□□□ -1.26
APS1P35181 ZAP1YJL056C 2643 nt7.15□□□□□ -1.26
APS1P35181 RET2YFR051C 1641 nt7.15□□□□□ -1.27
APS1P35181 SED1YDR077W 1017 nt7.14□□□□□ -1.27
APS1P35181 YNL115CYNL115C 1935 nt7.13□□□□□ -1.27
APS1P35181 PET8YNL003C 855 nt7.13□□□□□ -1.27
APS1P35181 PEX25YPL112C 1185 nt7.13□□□□□ -1.27
APS1P35181 ALD5YER073W 1563 nt7.12□□□□□ -1.27
APS1P35181 UFO1YML088W 2007 nt7.12□□□□□ -1.27
APS1P35181 YHR218WYHR218W 1812 nt7.12□□□□□ -1.27
APS1P35181 RFC1YOR217W 2586 nt7.1□□□□□ -1.27
APS1P35181 SAM1YLR180W 1149 nt7.1□□□□□ -1.27
APS1P35181 ODC1YPL134C 933 nt7.1□□□□□ -1.27
APS1P35181 LEU9YOR108W 1815 nt7.1□□□□□ -1.27
APS1P35181 QDR2YIL121W 1629 nt7.09□□□□□ -1.27
APS1P35181 PCP1YGR101W 1041 nt7.09□□□□□ -1.27
APS1P35181 ADO1YJR105W 1023 nt7.09□□□□□ -1.27
APS1P35181 YAR028WYAR028W 705 nt7.09□□□□□ -1.27
APS1P35181 PRE6YOL038W 765 nt7.09□□□□□ -1.27
APS1P35181 OYE3YPL171C 1203 nt7.09□□□□□ -1.27
APS1P35181 MRPL8YJL063C 717 nt7.08□□□□□ -1.28
APS1P35181 VPS62YGR141W 1404 nt7.08□□□□□ -1.28
APS1P35181 DIG1YPL049C 1359 nt7.08□□□□□ -1.28
APS1P35181 YDL086WYDL086W 822 nt7.07□□□□□ -1.28
APS1P35181 ACH1YBL015W 1581 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 TOA2YKL058W 369 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 YOR072WYOR072W 315 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 SPP2YOR148C 558 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 URA8YJR103W 1737 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 GAL2YLR081W 1725 nt7.04□□□□□ -1.28
APS1P35181 SSL2YIL143C 2532 nt7.03□□□□□ -1.28
APS1P35181 MDM35YKL053C-A 261 nt7.03□□□□□ -1.28
APS1P35181 PAU7YAR020C 168 nt7.03□□□□□ -1.28
APS1P35181 TOM6YOR045W 186 nt7.03□□□□□ -1.28
APS1P35181 ZTA1YBR046C 1005 nt7.03□□□□□ -1.28
APS1P35181 BRR1YPR057W 1026 nt7.03□□□□□ -1.28
APS1P35181 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.02□□□□□ -1.29
APS1P35181 SHB17YKR043C 816 nt7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms