Protein–RNA interactions for Protein: P33308

CSE2, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, yeastyeast

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE2P33308 TSC10YBR265W 963 nt10.54□□□□□ -0.72
CSE2P33308 STR3YGL184C 1398 nt10.53□□□□□ -0.72
CSE2P33308 YGR012WYGR012W 1182 nt10.52□□□□□ -0.73
CSE2P33308 LSC2YGR244C 1284 nt10.52□□□□□ -0.73
CSE2P33308 YML089CYML089C 369 nt10.52□□□□□ -0.73
CSE2P33308 NRT1YOR071C 1797 nt10.51□□□□□ -0.73
CSE2P33308 RIB3YDR487C 627 nt10.5□□□□□ -0.73
CSE2P33308 DUS1YML080W 1272 nt10.5□□□□□ -0.73
CSE2P33308 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.49□□□□□ -0.73
CSE2P33308 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.49□□□□□ -0.73
CSE2P33308 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.49□□□□□ -0.73
CSE2P33308 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.49□□□□□ -0.73
CSE2P33308 PRO1YDR300C 1287 nt10.49□□□□□ -0.73
CSE2P33308 AQY2YLL052C 450 nt10.48□□□□□ -0.73
CSE2P33308 TIF6YPR016C 738 nt10.48□□□□□ -0.73
CSE2P33308 MET28YIR017C 564 nt10.46□□□□□ -0.73
CSE2P33308 YLR279WYLR279W 390 nt10.45□□□□□ -0.74
CSE2P33308 YCL074WYCL074W 927 nt10.43□□□□□ -0.74
CSE2P33308 YLR349WYLR349W 507 nt10.42□□□□□ -0.74
CSE2P33308 STE4YOR212W 1272 nt10.42□□□□□ -0.74
CSE2P33308 ATG15YCR068W 1563 nt10.42□□□□□ -0.74
CSE2P33308 ARP6YLR085C 1317 nt10.41□□□□□ -0.74
CSE2P33308 FUN14YAL008W 597 nt10.39□□□□□ -0.75
CSE2P33308 YNR029CYNR029C 1290 nt10.39□□□□□ -0.75
CSE2P33308 MSB4YOL112W 1479 nt10.38□□□□□ -0.75
CSE2P33308 FIT3YOR383C 615 nt10.37□□□□□ -0.75
CSE2P33308 YJL195CYJL195C 702 nt10.34□□□□□ -0.75
CSE2P33308 RPM1RPM1 483 nt10.34□□□□□ -0.75
CSE2P33308 ADH1YOL086C 1047 nt10.33□□□□□ -0.76
CSE2P33308 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.33□□□□□ -0.76
CSE2P33308 GAP1YKR039W 1809 nt10.33□□□□□ -0.76
CSE2P33308 YPI1YFR003C 468 nt10.29□□□□□ -0.76
CSE2P33308 ADH7YCR105W 1086 nt10.27□□□□□ -0.77
CSE2P33308 RTN2YDL204W 1182 nt10.27□□□□□ -0.77
CSE2P33308 GND1YHR183W 1470 nt10.26□□□□□ -0.77
CSE2P33308 PLB1YMR008C 1995 nt10.26□□□□□ -0.77
CSE2P33308 FUR4YBR021W 1902 nt10.25□□□□□ -0.77
CSE2P33308 PAU15YIR041W 375 nt10.24□□□□□ -0.77
CSE2P33308 LOT5YKL183W 921 nt10.23□□□□□ -0.77
CSE2P33308 DIF1YLR437C 402 nt10.22□□□□□ -0.77
CSE2P33308 PAC11YDR488C 1602 nt10.22□□□□□ -0.77
CSE2P33308 YEL008WYEL008W 381 nt10.2□□□□□ -0.78
CSE2P33308 YAR028WYAR028W 705 nt10.2□□□□□ -0.78
CSE2P33308 ALP1YNL270C 1722 nt10.2□□□□□ -0.78
CSE2P33308 ZTA1YBR046C 1005 nt10.19□□□□□ -0.78
CSE2P33308 AAC1YMR056C 930 nt10.18□□□□□ -0.78
CSE2P33308 MTG2YHR168W 1557 nt10.18□□□□□ -0.78
CSE2P33308 GPN2YOR262W 1044 nt10.15□□□□□ -0.78
CSE2P33308 UTR1YJR049C 1593 nt10.14□□□□□ -0.79
CSE2P33308 AKR2YOR034C 2250 nt10.13□□□□□ -0.79
CSE2P33308 APT2YDR441C 546 nt10.13□□□□□ -0.79
CSE2P33308 CPD1YGR247W 720 nt10.13□□□□□ -0.79
CSE2P33308 FCY21YER060W 1587 nt10.13□□□□□ -0.79
CSE2P33308 SMM1YNR015W 1155 nt10.12□□□□□ -0.79
CSE2P33308 ESS1YJR017C 513 nt10.1□□□□□ -0.79
CSE2P33308 YGR259CYGR259C 441 nt10.08□□□□□ -0.8
CSE2P33308 YKR005CYKR005C 1578 nt10.08□□□□□ -0.8
CSE2P33308 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.06□□□□□ -0.8
CSE2P33308 RIB2YOL066C 1776 nt10.04□□□□□ -0.8
CSE2P33308 HXT12YIL170W 1374 nt10.03□□□□□ -0.8
CSE2P33308 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.03□□□□□ -0.8
CSE2P33308 PRY1YJL079C 900 nt10□□□□□ -0.81
CSE2P33308 SED1YDR077W 1017 nt9.99□□□□□ -0.81
CSE2P33308 UGA4YDL210W 1716 nt9.99□□□□□ -0.81
CSE2P33308 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.97□□□□□ -0.81
CSE2P33308 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.97□□□□□ -0.81
CSE2P33308 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.97□□□□□ -0.81
CSE2P33308 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.97□□□□□ -0.81
CSE2P33308 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.97□□□□□ -0.81
CSE2P33308 SAM35YHR083W 990 nt9.96□□□□□ -0.82
CSE2P33308 PRM5YIL117C 957 nt9.95□□□□□ -0.82
CSE2P33308 PRP4YPR178W 1398 nt9.95□□□□□ -0.82
CSE2P33308 VRG4YGL225W 1014 nt9.94□□□□□ -0.82
CSE2P33308 HSP60YLR259C 1719 nt9.93□□□□□ -0.82
CSE2P33308 ALD4YOR374W 1560 nt9.92□□□□□ -0.82
CSE2P33308 SEN2YLR105C 1134 nt9.91□□□□□ -0.82
CSE2P33308 LIP1YMR298W 453 nt9.9□□□□□ -0.82
CSE2P33308 PGC1YPL206C 966 nt9.9□□□□□ -0.82
CSE2P33308 DPS1YLL018C 1674 nt9.9□□□□□ -0.83
CSE2P33308 YJL055WYJL055W 738 nt9.89□□□□□ -0.83
CSE2P33308 NAP1YKR048C 1254 nt9.89□□□□□ -0.83
CSE2P33308 PUP1YOR157C 786 nt9.89□□□□□ -0.83
CSE2P33308 DBP1YPL119C 1854 nt9.88□□□□□ -0.83
CSE2P33308 YPL251WYPL251W 303 nt9.88□□□□□ -0.83
CSE2P33308 CCT5YJR064W 1689 nt9.87□□□□□ -0.83
CSE2P33308 BMT6YLR063W 1098 nt9.87□□□□□ -0.83
CSE2P33308 YBR232CYBR232C 360 nt9.87□□□□□ -0.83
CSE2P33308 IRC24YIR036C 792 nt9.85□□□□□ -0.83
CSE2P33308 CSM1YCR086W 573 nt9.84□□□□□ -0.83
CSE2P33308 LEU9YOR108W 1815 nt9.84□□□□□ -0.83
CSE2P33308 YBL086CYBL086C 1401 nt9.83□□□□□ -0.84
CSE2P33308 PAU5YFL020C 369 nt9.83□□□□□ -0.84
CSE2P33308 STP3YLR375W 1032 nt9.82□□□□□ -0.84
CSE2P33308 MEP3YPR138C 1470 nt9.8□□□□□ -0.84
CSE2P33308 BRR1YPR057W 1026 nt9.8□□□□□ -0.84
CSE2P33308 HXT1YHR094C 1713 nt9.79□□□□□ -0.84
CSE2P33308 YMR103CYMR103C 363 nt9.78□□□□□ -0.84
CSE2P33308 YJL118WYJL118W 660 nt9.77□□□□□ -0.85
CSE2P33308 GAL3YDR009W 1563 nt9.76□□□□□ -0.85
CSE2P33308 Q0182Q0182 405 nt9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.7 ms