Protein–RNA interactions for Protein: P16550

APA1, Protein APA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APA1P16550 LSC2YGR244C 1284 nt9.87□□□□□ -0.83
APA1P16550 RPL4BYDR012W 1089 nt9.86□□□□□ -0.83
APA1P16550 CLB6YGR109C 1143 nt9.86□□□□□ -0.83
APA1P16550 TOM6YOR045W 186 nt9.86□□□□□ -0.83
APA1P16550 RPL4AYBR031W 1089 nt9.86□□□□□ -0.83
APA1P16550 POM34YLR018C 900 nt9.85□□□□□ -0.83
APA1P16550 ALG12YNR030W 1656 nt9.84□□□□□ -0.83
APA1P16550 SSN3YPL042C 1668 nt9.84□□□□□ -0.83
APA1P16550 YML089CYML089C 369 nt9.84□□□□□ -0.83
APA1P16550 PRO1YDR300C 1287 nt9.83□□□□□ -0.84
APA1P16550 ARP6YLR085C 1317 nt9.82□□□□□ -0.84
APA1P16550 RTN2YDL204W 1182 nt9.81□□□□□ -0.84
APA1P16550 PEX2YJL210W 816 nt9.8□□□□□ -0.84
APA1P16550 UTH1YKR042W 1098 nt9.8□□□□□ -0.84
APA1P16550 ATG15YCR068W 1563 nt9.79□□□□□ -0.84
APA1P16550 RBG2YGR173W 1107 nt9.78□□□□□ -0.84
APA1P16550 YMR226CYMR226C 804 nt9.78□□□□□ -0.84
APA1P16550 YKR005CYKR005C 1578 nt9.77□□□□□ -0.85
APA1P16550 YGR259CYGR259C 441 nt9.77□□□□□ -0.85
APA1P16550 RPS14BYJL191W 417 nt9.77□□□□□ -0.85
APA1P16550 HIP1YGR191W 1812 nt9.77□□□□□ -0.85
APA1P16550 HSP60YLR259C 1719 nt9.76□□□□□ -0.85
APA1P16550 SDH5YOL071W 489 nt9.76□□□□□ -0.85
APA1P16550 PRP4YPR178W 1398 nt9.75□□□□□ -0.85
APA1P16550 NRT1YOR071C 1797 nt9.75□□□□□ -0.85
APA1P16550 YLR111WYLR111W 333 nt9.74□□□□□ -0.85
APA1P16550 GAP1YKR039W 1809 nt9.74□□□□□ -0.85
APA1P16550 MET28YIR017C 564 nt9.73□□□□□ -0.85
APA1P16550 TIF6YPR016C 738 nt9.73□□□□□ -0.85
APA1P16550 PLB1YMR008C 1995 nt9.73□□□□□ -0.85
APA1P16550 BMT6YLR063W 1098 nt9.71□□□□□ -0.86
APA1P16550 NME1NME1 340 nt9.71□□□□□ -0.86
APA1P16550 TSC10YBR265W 963 nt9.69□□□□□ -0.86
APA1P16550 Q0010Q0010 387 nt9.68□□□□□ -0.86
APA1P16550 DPS1YLL018C 1674 nt9.67□□□□□ -0.86
APA1P16550 RAD23YEL037C 1197 nt9.66□□□□□ -0.86
APA1P16550 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.63□□□□□ -0.87
APA1P16550 YGR012WYGR012W 1182 nt9.63□□□□□ -0.87
APA1P16550 FIT3YOR383C 615 nt9.63□□□□□ -0.87
APA1P16550 UTR1YJR049C 1593 nt9.6□□□□□ -0.87
APA1P16550 IRC24YIR036C 792 nt9.59□□□□□ -0.87
APA1P16550 YLR279WYLR279W 390 nt9.58□□□□□ -0.88
APA1P16550 DIF1YLR437C 402 nt9.58□□□□□ -0.88
APA1P16550 NAR1YNL240C 1476 nt9.57□□□□□ -0.88
APA1P16550 AAC1YMR056C 930 nt9.56□□□□□ -0.88
APA1P16550 RIB3YDR487C 627 nt9.55□□□□□ -0.88
APA1P16550 SAM35YHR083W 990 nt9.55□□□□□ -0.88
APA1P16550 YAR028WYAR028W 705 nt9.55□□□□□ -0.88
APA1P16550 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.53□□□□□ -0.88
APA1P16550 ALP1YNL270C 1722 nt9.52□□□□□ -0.89
APA1P16550 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.52□□□□□ -0.89
APA1P16550 MCM5YLR274W 2328 nt9.51□□□□□ -0.89
APA1P16550 SAM1YLR180W 1149 nt9.51□□□□□ -0.89
APA1P16550 MSB4YOL112W 1479 nt9.51□□□□□ -0.89
APA1P16550 PRM5YIL117C 957 nt9.5□□□□□ -0.89
APA1P16550 AKR2YOR034C 2250 nt9.49□□□□□ -0.89
APA1P16550 CAB5YDR196C 726 nt9.49□□□□□ -0.89
APA1P16550 MTG2YHR168W 1557 nt9.49□□□□□ -0.89
APA1P16550 ZTA1YBR046C 1005 nt9.47□□□□□ -0.89
APA1P16550 SNF1YDR477W 1902 nt9.45□□□□□ -0.9
APA1P16550 ALD4YOR374W 1560 nt9.42□□□□□ -0.9
APA1P16550 MAS1YLR163C 1389 nt9.42□□□□□ -0.9
APA1P16550 SED1YDR077W 1017 nt9.41□□□□□ -0.9
APA1P16550 HSL7YBR133C 2484 nt9.41□□□□□ -0.9
APA1P16550 CMP2YML057W 1815 nt9.4□□□□□ -0.91
APA1P16550 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.39□□□□□ -0.91
APA1P16550 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.39□□□□□ -0.91
APA1P16550 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.39□□□□□ -0.91
APA1P16550 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.39□□□□□ -0.91
APA1P16550 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.39□□□□□ -0.91
APA1P16550 YJR154WYJR154W 1041 nt9.38□□□□□ -0.91
APA1P16550 LIP1YMR298W 453 nt9.38□□□□□ -0.91
APA1P16550 GND1YHR183W 1470 nt9.38□□□□□ -0.91
APA1P16550 RSC4YKR008W 1878 nt9.37□□□□□ -0.91
APA1P16550 LOT5YKL183W 921 nt9.37□□□□□ -0.91
APA1P16550 YPI1YFR003C 468 nt9.35□□□□□ -0.91
APA1P16550 HIF1YLL022C 1158 nt9.35□□□□□ -0.91
APA1P16550 HXT1YHR094C 1713 nt9.34□□□□□ -0.92
APA1P16550 SMM1YNR015W 1155 nt9.33□□□□□ -0.92
APA1P16550 DBP1YPL119C 1854 nt9.32□□□□□ -0.92
APA1P16550 APT2YDR441C 546 nt9.32□□□□□ -0.92
APA1P16550 FCY21YER060W 1587 nt9.32□□□□□ -0.92
APA1P16550 BIO5YNR056C 1686 nt9.32□□□□□ -0.92
APA1P16550 ADH1YOL086C 1047 nt9.3□□□□□ -0.92
APA1P16550 HEL2YDR266C 1920 nt9.3□□□□□ -0.92
APA1P16550 YJL195CYJL195C 702 nt9.29□□□□□ -0.92
APA1P16550 ESBP6YNL125C 2022 nt9.28□□□□□ -0.92
APA1P16550 YBL086CYBL086C 1401 nt9.28□□□□□ -0.92
APA1P16550 FUN14YAL008W 597 nt9.27□□□□□ -0.93
APA1P16550 BRR1YPR057W 1026 nt9.27□□□□□ -0.93
APA1P16550 UGA4YDL210W 1716 nt9.26□□□□□ -0.93
APA1P16550 TOA2YKL058W 369 nt9.26□□□□□ -0.93
APA1P16550 YNR029CYNR029C 1290 nt9.26□□□□□ -0.93
APA1P16550 YPL251WYPL251W 303 nt9.26□□□□□ -0.93
APA1P16550 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.25□□□□□ -0.93
APA1P16550 LEU9YOR108W 1815 nt9.24□□□□□ -0.93
APA1P16550 MEP3YPR138C 1470 nt9.24□□□□□ -0.93
APA1P16550 PRY1YJL079C 900 nt9.23□□□□□ -0.93
APA1P16550 YMR103CYMR103C 363 nt9.23□□□□□ -0.93
APA1P16550 GID7YCL039W 2238 nt9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms