Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.2 ms