Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC17A6Q9P2U8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms