Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM42Q9BTD8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM42Q9BTD8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms