Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms