Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIRT1Q96EB6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIRT1Q96EB6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms