Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXNL1Q96CM4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NXNL1Q96CM4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms