Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE4Q8N205 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYNE4Q8N205 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms