Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PPARGC1BQ86YN6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms