Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHA9Q7RTU4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHA9Q7RTU4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms