Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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