Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms