Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms