Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP69A5D8W1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms