Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCTD3Q9Y597 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCTD3Q9Y597 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms