Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN11AQ9UI33 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms