Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVK13-1Q9NX77 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK13-1Q9NX77 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms