Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN1Q9BY11 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms