Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUDCD1Q96RS6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms