Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAG3L4Q8TBR4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
STAG3L4Q8TBR4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms