Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZD8Q8NEN9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD8Q8NEN9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms