Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC30Q5VVM6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC30Q5VVM6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms