Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80DQ53TQ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80DQ53TQ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms