Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A3Q16572 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A3Q16572 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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