Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMAD1Q15797 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD1Q15797 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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