Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIGQ13278 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIGQ13278 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIGQ13278 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIGQ13278 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIGQ13278 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIGQ13278 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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