Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HNF1AP20823 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms