Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARID3CA6NKF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARID3CA6NKF2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms