Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP69A5D8W1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP69A5D8W1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP69A5D8W1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP69A5D8W1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms