Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB6Q9Y5E3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB6Q9Y5E3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms